长期吃氨糖软骨素可能会引起过敏、恶心呕吐、胸闷、胃痛、反酸等药物副作用。
氨糖软骨素又称为氨基葡萄糖，为天然的氨基单糖，是关节软骨的组成基质，并广泛分布于结缔组织、皮肤组织和关节滑液等处。服用氨糖软骨素主要为了补充软骨代谢的成分，预防骨关节炎、骨质增生等多种疾病。
与其他药物相同，不仅有良好的药效作用，但同样也存在药物副作用。氨糖软骨素并不建议长期使用，一般以一个月为一个疗程，可持续使用3-5个月，但在服用3个月左右便可停药。
若长期服用可能会引起过敏、胃肠道反应，如恶心、胸闷、胃痛、呕吐、反酸等症状，本身患有胃溃疡、胃酸分泌较多等胃病，以及肝肾功能不全的患者，需在医生指导下用药。
一般情况下，长期吃氨糖软骨素的副作用主要是会对肠胃造成影响、过敏、引起结石等。具体分析如下：
1.对肠胃造成影响：氨糖软骨素主要是由于缓解骨关节不适，如果本身肠胃功能不是特别好，在用药之后可能会出现明显的腹痛、腹泻等表现，甚至也会伴随明显的食欲不振的表现。
2.过敏：如果对药物当中一些成分过敏，盲目地使用药物之后，也会伴随皮肤上面出现过敏表现，伴随皮肤瘙痒和皮疹等，甚至也会出现过敏性荨麻疹和过敏性哮喘的表现，从而会对患者的身体健康造成严重影响。
3.引起结石：氨糖软骨素具有一定补钙的作用，在平时如果长时间过量服用，很可能会导致血液当中的钙含量增多，从而会出现结石症状。
除以上比较常见的副作用以外，也会对肝肾功能造成影响。