牙龈长脓疱的治疗，应根据不同病因，采用不同的治疗方式：
1.牙周来源的牙龈长脓疱：牙龈炎和牙周炎主要为菌斑生物膜引起的牙周组织的疾病，临床症状可表现除牙龈的红肿出血，有时伴有牙龈长脓疱，其治疗一般通过洁治术和刮治术可彻底清除菌斑、牙石，消除造成菌斑滞留和局部刺激牙龈的因素，牙龈的炎症即可消退，牙龈的色、形、质可完全恢复正常。常用的局部药物为1%～3%的双氧水，0.12%～0.2%氯己定。
2.牙髓来源的牙龈长脓疱：牙髓来源的牙龈脓疱通常为根尖炎症通过牙槽骨、牙龈的排除瘘口，其治疗方法一般为根管治疗，通过根管彻底消除炎症，然后进行严密的充填治疗。
少数情况下为以上两种情况的复合病变，此时应明确诊断并从以上两点同时出发治疗疾病。无论哪一种情况，都应积极的治疗，到专科的口腔门诊接受治疗，防止病变进一步发展，而造成牙齿的缺失。
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