治疗脚臭的最佳方法就是找到具体病因如臭汗症、多汗症、足癣、系统疾病等，祛除病因，对症处理，通常包括药物治疗及一般治疗。
1.臭汗症、多汗症：因神经、内分泌导致足部多汗，从而使细菌或真菌大量繁殖，并分解足部皮肤角蛋白产生氨，混合汗液中的尿素、乳酸产生难闻的臭味。
此时需要避免精神紧张、情绪波动，必要时可口服阿托品，外用止汗剂等。同时需要保持足部清洁干燥，勤换洗鞋袜，穿宽松透气的鞋袜。
2.足癣：皮肤癣菌感染足部皮肤，可导致足部浸渍糜烂。继发细菌感染时，也会出现臭味。此时需要积极抗真菌治疗，如外用咪康唑、克霉唑软膏，口服伊曲康唑、特比萘芬等药物。
3.系统疾病：甲状腺功能亢进患者机体代谢快，容易导致足部多汗，从而滋生细菌发出臭味。糖尿病患者，足部发生溃疡时，容易继发细菌感染，也会发出臭味。此时需要积极治疗原发疾病，注意局部皮肤护理，尤其是糖尿病足。
出现脚臭，建议及时前往医院就诊，查明原因，对症处理，药物需遵医嘱使用。