幽门螺杆菌最佳根除法一般是四联疗法，另外还要注意饮食卫生。
四联疗法是目前根治幽门螺杆菌最常用的治疗方法，根治率能达到90%以上，主要是使用两种抗生素，一种铋剂和一种质子泵抑制剂进行治疗，如奥美拉唑、阿莫西林、克拉霉素、果胶铋，一般治疗14天可以根除。对于少数不能根除的，也可以通过补救治疗的方法继续治疗，主要是选择敏感性的抗生素进行个体化治疗。
四联疗法的根治率虽然很高，但是幽门螺杆菌会通过人与人之间传染，根除后可能会再次传染，所以平时应该要注意个人卫生，勤洗手，养成良好的饮食习惯，建议进行分餐制，认真清洗碗筷，尽量减少在公共场合就餐。
幽门螺杆菌四联疗法应该严格遵医嘱用药，不要随便用药，避免产生不良反应。
幽门螺杆菌的四联疗法是一种质子泵抑制剂，再加上一种铋剂，再加上两种抗生素。这一种质子泵抑制剂最常用的可能就是从80年代使用的奥美拉唑，到后来的雷贝拉唑、埃索美拉唑等等，目前市面上大概有七八种药物。铋剂是抑制幽门螺杆菌生长的药物，市面上常用的包括得必泰或者是丽珠得乐等等。抗生素在中国用的比较多的就是阿莫西林，再加上克拉霉素也就是红霉素这样的药物。当然有的患者可能会出现阿莫西林过敏的情况，这个时候可以把它换一换，换成其它的抗生素，比如换成红霉素、换成了四环素，再或者是换成甲硝唑、替硝锉等这些药物。克拉霉素有的患者会出现腹痛、腹泻的症状，这个时候也可以把它换成其它的抗生素，比如利复星等。
当然，目前随着整体医疗水平的提高，可以在胃镜下取一块小肉肉过来，做一个整体的幽门螺杆菌的药物敏感试验，这样根据药药敏实验来进一步指导我们的根除疗法，这样针对性更强、效果更好。
杀幽门螺杆菌的最好最有效的方法是采用四联疗法。
目前推荐铋剂四联作为主要的经验性根除幽门螺杆菌的方案。包括铋剂、质子泵抑制剂、两种抗生素，经典铋剂四联方案如：由质子泵抑制剂、铋剂、阿莫西林以及克拉霉素组成。
对于第一次根除治疗失败的患者，医生可在半年后在剩余的治疗方案中选择另一种进行补救治疗，对多种抗生素耐药者治疗前可以做药敏试验来选择敏感的抗生素，对于反复治疗失败的患者需要继续治疗时，医生会对患者进行个体化整体评估。
一般通过医生指导下规范的根除幽门螺旋杆菌的药物治疗，幽门螺杆菌感染可以治愈，但如果不注意饮食卫生和生活习惯，仍可以再次感染。