目前没有权威文献有治疗幽门螺杆菌最好的方法，临床上通常用三联或者四联药物治疗。
幽门螺旋杆菌是一种微厌氧传染性较强的致病菌。也是引起慢性胃炎、慢性萎缩性胃炎、胃溃疡、十二指肠溃疡及胃癌的常见细菌。临床上通常应用三、四联药物治疗。以两周为一个治疗疗程。
三联药物包括一种质子泵抑制剂和两种抗生素，四联药物则是在三联药物的基础上加入了一种铋剂。
临床上质子泵抑制剂常选用奥美拉唑、雷贝拉唑、泮托拉唑等，口服后可能会出现头痛、皮疹、失眠、腹胀等不良反应。抗生素常选用阿莫西林、甲硝唑、克拉霉素、左氧氟沙星等，对于药物过敏者禁用。铋剂常选用枸橼酸铋钾、胶体果胶铋等，口服后可能会出现恶心、便秘等不良反应。
以上药物属于处方用药，均不可自行用药，需在医生指导下规范用药。