长期吃海藻冻一般有副作用，生活中应避免长期应用，并且海藻冻并不能达到治疗疾病的作用，如果自身患有胃肠道疾病，应积极配合医生进行治疗。
海藻冻可以促进胃肠道蠕动，对于大便干结的人群有很好的改善作用，能够在一定程度上缓解便秘的情况。但是海藻冻如果生活中长期吃，通常是会有副作用的，可能会对胃肠道部位造成刺激，也有可能会增加胃肠道负担，可引起胃胀、胃痛等症状。如果长时间地吃，还会影响到胃肠道的正常生理功能，随之引起便秘。由于主要原材料为海藻，其中的碘元素含量比较高，如果长期吃有可能会因碘摄入过多引起甲状腺功能亢进症。
所以，在食用海藻冻时要注意适量，不要长期大量食用，以免对身体健康造成危害。