口服药物治疗肝脓肿时如果未确定病原菌之前使用广谱抗生素，常用的三代头孢（头孢克肟、头孢地尼等）联合甲硝唑或氨基糖苷类（阿米卡星、庆大霉素等）联合甲硝唑，对于部分病人可以升级高级抗生素（比阿培南）等，药物的效果因人而异。
1.三代头孢类（头孢克肟、头孢地尼）：对于链球菌属(肠球菌除外)，肺炎球菌、淋球菌、卡他布兰汉球菌、大肠杆菌有效，是常见的抗生素。
2.甲硝唑：用于治疗肠道和肠外阿米巴病(如阿米巴肝脓肿、胸膜阿米巴病等)，还可以用于厌氧菌的感染。
3.氨基糖苷类（阿米卡星、庆大霉素等）：其以抗需氧革兰阴性杆菌、假单胞菌属、结核菌属和葡萄菌属为特点，由于氨基糖苷类抗生素在发挥抗菌作用时必须有氧参加，所以对厌氧菌无效。
3.比阿培南：治疗由敏感细菌所引起的败血症、肺炎、肝脓肿、慢性呼吸道疾病引起的二次感染、难治性膀胱炎、肾盂肾炎等。
若确诊肝脓肿，请及时就医，在医生的建议下规范使用药物。