肠镜检查前需要喝泻药，检查前三天尽量吃一些少渣、纤维素少的食物。检查前一天晚上6点，要喝两袋泻药，即聚乙二醇4000散。检查当天早上6点再喝一袋泻药。
肠镜检查时采取左侧卧位，从肛门进镜直至回肠末端进行检查。如果有疾病，需要做活检。如有需要，要按照医生的指引改变体位。
检查后注意不能做高危工作，尤其是驾车或者是谈重要业务。
肠镜分为普通肠镜和无痛肠镜，无痛肠镜与普通肠镜的区别在于无痛肠镜是在麻醉或镇静下完成，患者无腹胀、腹痛、腹部不适等异常感觉。做肠镜检查前2-3天均需进行低渣饮食，如粥、粉、面等，切勿食用蔬菜、水果；检查前1天需服用泻药，将肠道彻底清洁；检查时是通过一根软管插入肛门，对整个大肠和回肠末端进行检查。
做肠镜的流程大致可分为前、中、后三个阶段。
做肠镜检查前三天需要进食易消化食物，并且在检查当天禁食，服用泻药来将肠道清理干净，以免影响检查。
检查时肠镜经肛门进入，从直肠进入乙状结肠、降结肠、横结肠、升结肠，最后进入回肠，检查整个肠道状态，当出现可疑部位再进行详细的检查，或者进行活检。
检查后需要根据检查的结果进行判断，在医生的指导下看需要注意什么以及是否需要进行治疗。