咽肌痉挛大多原因不明，慢性咽炎、长期烟酒过度、理化因素和鼻腔分泌物长期刺激咽部等均可引发咽肌痉挛。
咽部肌肉主要受咽丛的运动神经纤维支配，咽运动神经功能障碍可引起咽肌麻痹和咽肌痉挛。咽肌痉挛又名腭部肌阵挛，是一种少见的疾病，为软腭或咽缩肌的不随意而有节律地收缩运动，可局限于一处，或在几个部位同时发生，多为双侧对称性。
咽肌痉挛常是咽肌麻痹的先兆，因此，引起咽肌麻痹的病因常导致咽肌痉挛。咽肌痉挛临床分为两类，分别为强直性咽肌痉挛与节律性咽肌痉挛。
1.强直性咽肌痉挛常发生于狂犬病、破伤风、癫痫、脑膜炎和癔症等，严重者伴有牙关紧闭、张口困难等症状，轻者有吞咽障碍、咽内不适、作呕等。
2.节律性咽肌痉挛常继发于脑干部特别是下橄榄区病变，在病人不知不觉中出现，软腭和咽肌发生规律性或不规律性收缩运动，每分钟可达60～100次以上，与脉搏、呼吸无关，并在入睡和麻醉后仍不停止；发作时，病人和他人都能听到咯咯声响，即所谓他觉性耳鸣。