右上腹腹痛的原因大致可分为两种，其一是疾病的影响；其二是生理性的反应。引起右上腹腹痛疾病大多是肝胆疾病、胃及十二指肠疾病，少数为非消化系统性疾病；生理性的右上腹腹痛主要见于运动中。
1.肝脏疾病。
某些肝脏疾病如慢性肝炎、肝结核、原发性肝癌等常常会引起人体右上腹持续性或间断性隐痛不适。
2.胃部疾病。
消化性溃疡是引起慢性右上腹腹痛的主要原因，此种腹痛疼痛剧烈且病程长，常常反复发作；胃癌，尤其是胃窦癌发生肝转移时常表现为右上腹部疼痛。
3.慢性胆系疾病。
胆石症、慢性胆囊炎、胆囊切除术后综合征等疾病导致右上腹部出现反复发作性的、不同程度的绞痛或隐痛。
4.非消化系统性疾病。
胸椎间旁突出、胸椎骨质增生、腹直肌纤维组织炎等疾病使得右上腹出现持续隐痛、胀痛或刺痛，但疼痛程度较轻。
出现右上腹腹痛严重者，应及时就医诊治。