囊肿是否需要手术切除，要根据囊肿的位置、大小、性质以及其他情况来综合判定。满足较小、不影响正常生活等情况时可不手术切除；较大，干扰到正常生活等情况时应手术切除。
如果囊肿较小、位置不影响患者的正常生活也不压迫到重要组织血管神经，那么就不用进行手术切除；相反，如果囊肿较大、位置干扰到人的正常生活甚至严重压迫到了身体器官和一些血管神经，甚至出现了癌变的严重情况时，就应立即到医院进行手术切除。
囊肿出现的位置往往是决定是否需要进行囊肿切除手术的重要考察依据：如果囊肿生长在一些非关键器官上或者没有生长到关键器官的关键位置处，那么一般都不需要进行手术切除；而一旦囊肿生长在了关键的位置处，就应当由医生尽早行外科手术治疗。