肠道感染引起发烧的处理包括退烧、降温处理、补液支持治疗及病原治疗。对于低烧的处理，可以采取冷敷或贴退烧贴等物理方法降温，如果体温大于38度5，则需要配合使用退热药，如服用对乙酰氨基酚、芬必得等药物进行退烧。
关于补液支持的治疗，不仅可以纠正腹泻病人引起的脱水、低血压，同时大量的补液也有助于降温。主要是通过口服补液或静脉输液的方法来补充液体和电解质。
关于病原治疗，要根据不同的病原菌采取相应的措施，一般病毒感染引起的肠道感染，以对症支持治疗为主，不用进行抗病毒治疗；严重的细菌性肠道感染，需要用抗生素，如喹诺酮类抗生素、头孢三代抗生素进行抗炎治疗。
肠道感染会引起发烧，尤其是细菌性肠道感染常伴有发热的症状，病毒感染引起的肠道感染，发热一般不是很明显或仅为低热。肠道感染是指各种病原微生物感染肠道引起的一种具有感染性的疾病，以细菌性和病毒性肠道感染较为常见。
细菌性肠道感染的病原体主要由沙门氏菌、弯曲杆菌、志贺菌、大肠杆菌、梭状芽孢杆菌等。临床表现常有发烧、腹痛、腹泻、排黏液便或脓血便等。化验检查血液有白细胞和中性粒细胞的明显升高，大便内可找到大量白细胞及少数红细胞。病毒感染引起的肠道感染，一般为水样便，可以伴有呕吐、腹胀、腹痛。