皮肤疾病相关
肛周湿疹：多与局部潮湿、过敏等因素有关。例如，长期穿着不透气的内裤，会使肛周局部环境潮湿，容易诱发肛周湿疹，出现半夜肛门瘙痒的情况，还可能伴有肛周皮肤红斑、丘疹、渗出等表现。不同年龄段人群均可发病，儿童若长期使用尿布且更换不及时，也易患肛周湿疹导致夜间肛门瘙痒；成年女性若有妇科炎症，阴道分泌物刺激肛周皮肤也可能引发。
肛门周围真菌感染：如股癣蔓延至肛周，由皮肤癣菌感染引起。温暖潮湿的环境利于真菌生长繁殖，比如肥胖人群、长期处于高温环境工作的人，皮肤易出汗潮湿，增加了真菌感染的风险，可表现为肛门周围皮肤瘙痒、脱屑，边界清楚的红斑等，夜间瘙痒可能更为明显。
寄生虫感染
蛲虫感染：多见于儿童，夜间雌蛲虫爬出肛门产卵，刺激肛周皮肤引起瘙痒。儿童卫生习惯不佳时易感染，患儿常表现为夜间肛门及会阴部奇痒，可伴有睡眠不安等，家长可能发现患儿肛周皮肤有抓痕。
全身性疾病影响
糖尿病：糖尿病患者血糖控制不佳时，皮肤含糖量升高，利于细菌、真菌滋生，容易出现皮肤瘙痒等并发症，包括肛门瘙痒。糖尿病患者无论年龄大小，若血糖长期偏高且未得到有效控制，都可能出现这种情况，夜间由于注意力相对集中，瘙痒感可能更突出。
肝胆疾病：如胆汁淤积症，由于胆汁排泄不畅，血液中胆盐含量升高，沉积于皮肤刺激神经末梢，可引起全身皮肤瘙痒，包括肛门部位。各类肝胆疾病患者，尤其是病情处于胆汁淤积阶段的，可能出现半夜肛门瘙痒，同时可能伴有皮肤黄染等表现。
不良生活习惯因素
卫生习惯差：不注意肛门局部清洁，粪便残渣残留刺激肛周皮肤，长期可导致瘙痒。无论男女老少，若长期不清洗肛门，都可能引发问题，儿童若家长未教导良好的肛周清洁习惯，也易出现夜间肛门瘙痒；成年男性若有久坐且不注重清洁的情况，也增加风险。
饮食因素：食用辛辣、刺激性食物后，可能会对肛门周围皮肤产生刺激，导致瘙痒。比如经常大量食用辣椒、花椒等辛辣食物的人群，容易出现这种情况，夜间可能因身体对刺激的反应而感觉肛门瘙痒加剧。