口腔溃疡的治疗方法包括局部药物缓解疼痛、促进愈合，中医诊治根治复发，激光等新型疗法等。
1.局部用药:主要的原则是减少疼痛、促进愈合，主要的药物是糖皮质类激素、生长因子凝胶、聚维酮碘含漱液、呋喃西林糊剂等。因为口腔溃疡病因复杂，目前发病机制不明确，局部用药只是对症治疗，并非对因治疗。
2.中医疗法:对于复发性口腔溃疡，患者可以到中医科就诊，调理机体，提高免疫功能，延长复发间隔，缩短病程。
3.新型疗法:激光主要是可以辅助促进溃疡愈合，但是目前临床效果还有待进一步研究。
建议口腔溃疡的患者在医生指导下进行正规治疗。
口腔溃疡的治疗分为一般治疗和药物治疗。
1.一般治疗：多吃新鲜的水果、蔬菜，多喝水，保持大便通畅以及口腔湿润，保证充足的睡眠。避免过度的疲劳，加强锻炼，增强免疫力等。
2.药物治疗：口腔溃疡是首选选择局部用药，止痛药有利多卡因凝胶、喷剂等，消炎药有氯己定含漱液、西地碘片等，促进愈合药物有口腔溃疡散剂、西瓜霜等，还可用康复新液等治疗，如症状较重、复发频率较高的患者，可使用全身用药，如免疫制剂，转移因等。
除了以上治疗外，还可采用中药治疗，在进行中药治疗时，主要是辨清证型，才能更好、更准确的用药治疗。