手指甲上有凹陷竖纹可能是正常指甲表现，或微量元素缺乏、灰指甲、肢端血液循环障碍性疾病等原因导致的。
1.正常指甲：正常指甲是有一些竖条纹存在的，一般不明显，不引起明显不适，无需处理。
2.微量元素缺乏：人体中钙、铁、锌等微量元素的缺乏可能会引起手指甲上出现凹陷、竖纹等症状。例如，长期存在挑食、偏食，可能会使机体缺乏所需的微量元素，引起缺铁性贫血、营养不良等疾病的发生，进而出现手指甲相关表现。此外，慢性胃肠炎患者长期腹泻可能会导致体内多种微量元素的丢失，进而使手指甲出现凹陷、竖纹。
3.灰指甲：灰指甲又称甲癣，是由皮肤癣菌等多种微生物侵犯甲板及甲下引起的指甲病变，可能会使患者手指甲出现凹陷、竖条纹，此外还可能表现为指甲的浑浊、增厚、分离、变色、萎缩、脱落、翘起、疼痛、甲下出血等症状。
4.肢端血液循环障碍性疾病：硬皮病、雷诺病等肢端血液循环障碍性疾病可能会因循环障碍影响甲母质的正常功能，导致甲板形成缺陷，从而出现甲板凹陷、竖条纹、变薄、生长缓慢、分层等症状。
综上，建议手指甲上有凹陷竖纹的患者前往医院明确病因、及时治疗，避免病情进一步加重。