引起囊肿的原因有多种，包括遗传性因素、外伤、感染等。
1.遗传性因素：部分囊肿是遗传基因所致的先天发育异常，如多发性脂囊瘤、皮样囊肿、甲状腺舌骨导管囊肿等。
2.外伤：部分人群受到外伤后造成脏器或者淋巴管受到损伤，进而形成囊肿。
3.感染：常见的如患急性胰腺炎时，并发感染造成胰腺大量渗出，可能形成胰腺假性囊肿。
由于囊肿多数为良性病变，若是囊肿体积不大，多随访观察即可，不需要进行特殊处理；但若是囊肿进行性增大，需要由医师评估后进行手术切除或者引流。
囊肿是指内含液体或半固体物质的囊性皮肤损害。可隆起于皮肤表面，或发生在皮内、皮下。不同性质的囊肿，其形成原因也不相同，可表现如下：
1.表皮囊肿：多是毛皮脂腺受到损害所致，也可发生于皮肤创伤后使表皮植入真皮。
2.皮样囊肿：出生时即有，是由胚胎闭合线上由分离的表皮细胞形成的囊肿。
3.毛根鞘囊肿：多数认为是由遗传因素导致。
4.多发性皮脂腺囊肿：属于常染色体显性遗传病，多见于青春期男性。